Ηλέκτρα Κωστοπούλου έλαβε και τα δύο B.A. πτυχίο (2001) στην Ιστορία και την Αρχαιολογία (με ειδίκευση στην Τουρκική και Βαλκανική Ιστορία και ένα μικρό στην Ελληνική Φιλολογία) και μεταπτυχιακό τίτλο (2004) στην Τουρκική και Βαλκανική ιστορία από το Αριστοτέλειο Πανεπιστήμιο Θεσσαλονίκης. Η μεταπτυχιακή της διατριβή στο νησί της Λέρου στο τέλος της οθωμανικής εποχής δημοσιεύτηκε στα ελληνικά ως μονογραφία με τίτλο Το νησί της Λέρου ως οθωμανική επαρχία: Ιστορία μέσα από τα βιβλία των τοπικών πρεσβυτέρων (Αθήνα: 2005). Η Ηλέκτρα Κωστοπούλου έλαβε το διδακτορικό της. πτυχίο στην Οθωμανική Ιστορία από το Πανεπιστήμιο Bogazici, Κωνσταντινούπολη, το 2009. Η διδακτορική της διατριβή με θέμα «Το« μουσουλμανικό κεχρί »της Αυτόνομης Κρήτης» κέρδισε το Βραβείο του Πανεπιστημίου για την Ακαδημαϊκή Αριστεία στην Έρευνα. Η διατριβή εξετάζει τον αγωνιώδη μετασχηματισμό της Ανατολικής Μεσογείου κατά την εποχή της όψιμης νεωτερικότητας, μέσω της εξέτασης μιας εστιασμένης μελέτης περίπτωσης: οι μουσουλμάνοι πολίτες της Αυτόνομης Κρήτης. Η Ηλέκτρα Κωστοπούλου έχει διδάξει (2006-10) στο Τμήμα Ιστορίας, Πανεπιστήμιο Bilgi, Κωνσταντινούπολη, ως βοηθός διδασκαλίας, εκπαιδευτής και επίκουρη καθηγήτρια.
